报告题目:Probing allostery through DNA: interplay between theory and experiments
报告人:葛颢 研究员(北京大学生物动态光学成像中心)
时间:2013年11月15日(星期五)下午15:30
地点:武汉物数所综合楼四楼会议室
欢迎参加!
报告摘要:
我们详细研究了DNA和蛋白质相互作用中的别构合作效应,并提出了初步的理论分析。实验中发现某一种蛋白质分子与DNA 的结合会增强或者削弱另一种蛋白质分子与DNA的结合,而且这种改变随着这两个结合位点间的距离而呈现一种阻尼振荡现象,其周期正好是DNA双螺旋结构的周期。理论方面,我们先利用平衡态统计物理 模型解释了这种“同时性”;然后利用分子动力学模拟,研究了位于同一个DNA分子不同位置的大沟动力学之间的相关性,以及DNA受到扰动后大沟的形状变 化,得到了与实验吻合的阻尼振荡曲线。